科學(xué)研究:冷適應(yīng)酶可以在室溫下轉(zhuǎn)化
(圖片來源:CC0 Public Domain)
嗜冷生物生活在低溫環(huán)境中(接近水的冰點(diǎn)),其產(chǎn)生的酶表現(xiàn)出非常獨(dú)特的性質(zhì)。在《自然-通訊》(Nature Communications)所發(fā)表的一項(xiàng)新研究中,烏普薩拉大學(xué)的科學(xué)家利用大規(guī)模計(jì)算來解釋許多冷適應(yīng)酶在室溫左右失效的原因。
酶是維持所有活細(xì)胞新陳代謝的“機(jī)器”,但不幸的是,低溫下,生化反應(yīng)通常難以進(jìn)行。進(jìn)化已經(jīng)解決了這個(gè)問題,在內(nèi)部細(xì)胞溫度與外部寒冷環(huán)境相同的物種中形成了冷適應(yīng)酶。從細(xì)菌、某些植物到冷血脊椎動(dòng)物,無數(shù)生物具有這種特性,比如生活在寒水中的魚。這些冷適應(yīng)酶具有特殊的熱力學(xué)性質(zhì),從而能在極冷條件下發(fā)揮作用。顯然,它們的熔化溫度也比普通酶低,但探討它們的熔點(diǎn)是否在40攝氏度左右沒太大意義,因?yàn)樗鼈冇肋h(yuǎn)不需要在如此溫暖的環(huán)境中發(fā)揮作用。
然而,一個(gè)尚未解開的謎團(tuán)是為什么許多冷適應(yīng)酶甚至在室溫下,即遠(yuǎn)未到熔點(diǎn)時(shí)就失效。近期,研究人員查卡·索坎(Jaka Socan)、米哈·帕格(Miha Purg)和約翰·阿克維斯特(Johan??qvist)首次通過大量計(jì)算機(jī)模擬成功解開謎團(tuán)。
科學(xué)家模擬了一種來自南極細(xì)菌的淀粉降解酶在不同溫度下的化學(xué)反應(yīng),并將其與一頭普通溫血豬的淀粉降解酶計(jì)算結(jié)果進(jìn)行比較。事實(shí)證明,即使在室溫下,南極酶也開始局部分解,這一缺陷大大降低了淀粉分子對(duì)酶的粘附程度。該現(xiàn)象在低于熔點(diǎn)15攝氏度時(shí)發(fā)生,分解速率逐漸增加直到25攝氏度時(shí)達(dá)到最大。另一方面,豬身上酶降解淀粉的速度隨溫度上升持續(xù)增加,直至最終大約60攝氏度時(shí)失活。 因此通過計(jì)算機(jī)運(yùn)算,可以確認(rèn)冷適應(yīng)酶的哪些部分能引起其特殊性質(zhì)。
烏普薩拉大學(xué)細(xì)胞與分子生物學(xué)理論化學(xué)教授約翰·阿克維斯特表示:“新的結(jié)果和先前對(duì)各種冷適應(yīng)酶及其突變體的計(jì)算機(jī)模擬結(jié)果都表明,目前我們已經(jīng)達(dá)到了一個(gè)階段,以可預(yù)測(cè)的方式合理地重新設(shè)計(jì)酶并改變其性質(zhì)。長(zhǎng)期以來,這種手段一直是研究的目標(biāo),但截至目前,它還無法與酶分子定向進(jìn)化方法相抗衡。弗朗西斯·阿諾德(Frances Arnold)就酶分子定向進(jìn)化技術(shù)于2018年獲得諾貝爾獎(jiǎng)。”
翻譯:李雅婷
審校:董子晨曦
引進(jìn)來源:烏普薩拉大學(xué)
引進(jìn)鏈接:
https://phys.org/news/2020-05-cold-adapted-enzymes-room-temperature.html
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